高级别浆液性卵巢癌复发相关的潜在功能性关键miRNA-mRNA:基于生物信息学方法

摘要：

目的 探讨在高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)中的潜在功能性miRNA-mRNA调控网络与复发的相关性及其生物学意义.方法 使用来自癌症和肿瘤基因图谱(TCGA)数据库的HGSOC患者样本表达数据,根据基因本体论生物过程(GO_BP)将HGSOC患者分成不同的亚型,分析不同亚型与复发的相关性;通过基因表达综合(GEO)数据库找到两个与复发相关的数据集,与TCGA数据取交集,获得共同差异表达的miRNAs;预测miRNAs的靶基因,构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络;通过RT-qPCR及Western blot检测miR-506-3p与SNAI2的表达水平;双荧光素酶实验验证miR-506-3p与SNAI2的靶向结合;划痕实验及Trans well实验检测miR-506-3p对卵巢癌细胞迁移与侵袭的影响.结果 共筛选出与HGSOC相关通路活性的303个GO通路,确定两个亚型C1和C2.亚型与复发相关,C1患者的复发概率显著高于C2患者.C1和C2亚型之间的差异表达基因主要富集在上皮间质转化(EMT)通路,GSE25204、GSE73582及TCGA 3个数据集中有5个共同差异表达的miRNAs,共有41个靶基因能在C1和C2亚型之间差异表达的EMT通路中找到,利用这5个miRNAs及41个mRNAs构建与HGSOC复发相关的关键miRNA-mRNA网络.MiR-506-3p与SNAI2靶向结合,上调miR-506-3p抑制了SNAI2表达及降低SKOV3和CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05);而敲低miR-506-3p显著上调SNAI2表达水平及增强SKOV3和CAOV3的迁移及侵袭(P<0.05).结论 miR-506-3p和SNAI2是与HGSOC复发相关的关键分子,miR-506-3p可能通过SNAI2调控卵巢癌细胞的迁移和侵袭影响EMT,对HGSOC的复发有预测价值.

关键词：高级别浆液性卵巢癌、复发、上皮间质转化、miRNA

所属期刊栏目：43

分类号：R737.31;S813.3;R392.11

资助基金：国家自然科学基金81874213

在线出版日期：2023-03-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：8-16