焦磷酸测序和MassARRAY定量检测DNA甲基化在年龄推断中的差异

摘要：

目的 利用MassARRAY和焦磷酸测序两种方法 检测的DNA甲基化数据在年龄推断中的差异,探讨两种检测方法 的年龄推断计算方法 .方法 应用MassARRAY和焦磷酸测序,分别对65份和62份外周血样本的9个CpG位点的甲基化水平进行测定,运用多元线性回归模型预测年龄,对比预测年龄与实际年龄之间的差异;对比Z-score转化前后两种方法 之间的年龄预测差异.结果 MassARRAY法,65样本集数据Z-score转化前,平均绝对误差(MAD)=2.49岁,Z-score转化后,MAD=2.44岁;62样本集数据Z-score转化前,MAD=3.36岁,Z-score转化后,MAD=3.42岁.焦磷酸测序法,65样本集数据Z-score转化前,MAD=4.20岁,Z-score转化后,MAD=2.76岁;62样本集数据Z-score转化前,MAD=3.92岁,Z-score转化后,MAD=3.63岁.结论 Z-score转化方法 能够有效的消除MassARRAY和焦磷酸测序数据之间的系统性批次效应;MassARRAY数据可以直接使用进行样本的年龄预测;使用焦磷酸测序数据进行年龄预测结果 误差较大,但可以通过多样本积累进行Z-score转化之后预测年龄.

关键词：年龄推断、DNA甲基化、MassARRAY、焦磷酸测序、逐步多元线性回归模型、Z-score

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资助基金：国家重点研发计划资助项目;公安部技术研究计划项目

在线出版日期：2021-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1831-1837