乳腺癌基因药物网络模型的构建与分析

摘要：

目的 构建乳腺癌基因药物网络模型,提取并预测乳腺癌相关基因药物间的关联.方法 基于“ABC理论”和关联规则,提出一种生物实体间关联算法,以乳腺癌为例,提取乳腺癌相关基因与基因、药物与药物、基因与药物3种不同层次的关联,采用R语言实现网络模型的可视化,最后利用ROC曲线验证算法可靠性.结果 得到乳腺癌相关基因185种,98种不同关联;乳腺癌相关药物97种,170种不同关联;乳腺癌相关基因与药物网络中含有127种基因和77种药物,共384种不同关联.结论 乳腺癌的基因药物之间存在大量不同强度的关联,并且发现一些具有高度关联但尚未验证的生物实体对,为乳腺癌个性化诊治提供了新的研究思路.

关键词：乳腺癌、基因、药物、网络模型、R语言

所属期刊栏目：36

分类号：TP3;R73

资助基金：国家自然科学基金31500999;安徽省高等学校自然科学研究一般项目KJ2015B057bySupported by National Natural Science Foundation of China31500999

在线出版日期：2016-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：170-179