麝鼠繁殖期和非繁殖期肠道微生物组成的比较分析

摘要：

肠道中存在的大量微生物在协同进化和相互选择下与宿主形成了一个动态稳定的环境,其组成受多方面因素影响.本试验旨在比较繁殖期与非繁殖期麝鼠肠道微生物组成的差异,为麝鼠的高效养殖提供理论参考.在繁殖期与非繁殖期各取5只麝鼠,基于Illumina MiSeq测序平台对盲肠内容物进行16S rRNA基因测序.结果显示:α多样性分析表明麝鼠非繁殖期肠道微生物丰富度和均匀度高于繁殖期,β多样性分析表明麝鼠繁殖期与非繁殖期肠道微生物存在一定差异.物种组成分析表明麝鼠肠道微生物中优势菌门为拟杆菌门(Bacteroidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌属为普氏菌属(Prevotella)、巴恩斯氏菌属(Barnesiella)、梭菌属ⅩⅣa簇(Clostridium_ⅩⅣa)和瘤胃球菌属(Ruminococcus).物种差异分析表明,相对于非繁殖期,麝鼠在繁殖期有44个菌群的相对丰度减少,有52个菌群的相对丰度增加;在非繁殖期毛螺菌科(Lachnospiraceae)和梭菌目(Clostridiales)的相对丰度显著增加(P＜0.05),在繁殖期鞘脂杆菌科(Sphingobacteriaceae)、梭菌科 1(Clostridiaceae_1)、消化链球菌科(Peptostreptococcaceae)、弯曲菌科(Campylobacteraceae)、肠杆菌科(Enterobacteriaceae)的相对丰度显著增加(P＜0.05).功能预测显示麝鼠繁殖期多数差异菌群富集于代谢相关通路,包括氨基酸代谢、辅助因子和维生素代谢以及能量代谢.由此可见,与非繁殖期麝鼠相比,繁殖期麝鼠肠道微生物组成发生了改变,且差异菌群多富集于营养代谢相关通路,有利于保障麝鼠繁殖活动.

关键词：麝鼠、肠道微生物、16S rRNA测序、季节性繁殖

所属期刊栏目：35

分类号：Q93(微生物学)

资助基金：国家自然科学基金;大学生创新创业训练计划资助项目;大学生创新创业训练计划资助项目

在线出版日期：2023-08-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：4752-4760