大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸含量研究

摘要：

本试验旨在研究大约克猪肠道不同部位的菌群结构和短链脂肪酸( SCFA)含量的异同.试验选取3头体重为(121.00±2.89) kg的180日龄大约克母猪,采集其十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠内容物,提取微生物基因组DNA进行高通量测序分析其菌群结构,并测定SCFA含量.结果表明:从十二指肠至结肠中细菌总数、厚壁菌门( Firmicutes)和拟杆菌门( Bacte?roidetes)均在显著增加( P＜0.05) .相对于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠的菌群物种组成更丰富,多样性及均匀程度更高( P＜0.05) .在门水平上,厚壁菌门在各肠段菌群中均占绝对优势,相对丰度其次的门在十二指肠、空肠和回肠中为变形菌门( Proteobacteria) ,而在盲肠和结肠中为拟杆菌门;在属水平上,厚壁菌门的乳杆菌属、SMB53、梭菌属( Clostridium)以及变形菌门的弧菌属( Vibrio)为十二指肠、空肠和回肠中相对丰度较高的属;而厚壁菌门的乳杆菌属( Lacto?bacillus) 、SMB53、链球菌属( Streptococcus)以及拟杆菌门的普氏菌属( Prevotella)是盲肠和结肠中相对丰度较高的属.相比于十二指肠、空肠和回肠,盲肠和结肠中的乳杆菌属、弧菌属、葡萄球菌属( Staphylococcus)和不动杆菌属( Acinetobacter)相对丰度显著降低( P＜0.05) ,而瘤胃球菌属( Ruminococcus) 、拟杆菌属( Bacteroides) 、普氏菌属、粪球菌属( Coprococcus) 、颤螺菌属( Os?cillospira) 、罗氏菌属( Roseburia) 、毛螺菌属( Lachnospira)和粪杆菌属( Faecalibacterium)等SC?FA产生菌的相对丰度显著升高( P＜0.05) . beta多样性分析表明,十二指肠、空肠和回肠中的菌群结构相似性较高,盲肠和结肠两者之间菌群相似度较高,且与小肠段显著不同( P＜0.05) ,同时盲肠和结肠内容物中的SCFA含量显著高于小肠段( P＜0.05) .由此可见,大约克猪小肠和大肠中的菌群结构存在显著差异,小肠中以厚壁菌门和变形菌门为主,大肠中菌群以厚壁菌门和拟杆菌门为主.大肠段拟杆菌属、普氏菌属、魏斯氏菌属( Weissella) 、罗氏菌属、密螺旋体属( Trep?onema)和瘤胃球菌属等典型SCFA产生菌的相对丰度较高,同时其SCFA含量也较高,二者呈显著正相关.

关键词：大约克猪、肠道菌群、高通量测序、短链脂肪酸

所属期刊栏目：31

分类号：S828(家畜)

资助基金：贵州大学博士基金2012021;金华市科学技术局农业类重点项目2016?2?001;贵州省中药现代化科技产业研究开发专项项目20135029

在线出版日期：2019-11-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：4509-4518