采用Illumina MiSeq测序技术分析葡萄籽原花青素对奶牛体外瘤胃发酵产甲烷菌区系的影响

摘要：

本研究旨在基于Illumina MiSeq测序技术分析葡萄籽原花青素对奶牛体外瘤胃发酵产甲烷菌区系的影响.试验分为6组, 以500 g精粗比为40:60的全混合日粮为发酵底物, 分别添加0 (对照) 、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5 g/kg的葡萄籽原花青素.体外发酵24 h后提取各发酵液总DNA, 采用Illumina MiSeq PE300高通量测序平台进行测序.结果表明:1) 与对照组相比, 添加0.1、0.2 g/kg葡萄籽原花青素降低了产甲烷菌的分类操作单元 (OTUs) 数量, 添加0.3、0.4、0.5 g/kg葡萄籽原花青素增加了产甲烷菌的OTUs数量, 但差异并不显著 (P>0.05) ;葡萄籽原花青素添加量对Chao1指数和Shannon指数均无显著影响 (P>0.05) , 即对产甲烷菌的多样性没有显著影响.2) 在门水平上, 与对照组相比, 添加0.3、0.4、0.5 g/kg葡萄籽原花青素显著降低了广古菌门的丰度 (P<0.05) .在科水平上, 与对照组相比, 甲烷杆菌科的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加有降低的趋势, 且在添加量为0.4 g/kg时丰度显著降低 (P<0.05) ; Methanomassiliicoccaceae的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而增加, 且当添加量为0.3、0.4 g/kg时显著增加 (P<0.05) .在属水平上, 与对照组相比, 甲烷短杆菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低, 且当添加量为0.4 g/kg时显著降低 (P<0.05) , 当添加量为0.5 g/kg时有回升的趋势, 但是仍低于对照组;甲烷杆菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低, 且当添加量为0.4、0.5 g/kg时显著降低了该属的丰度 (P<0.05) ; Candidatus_Methanoplasma的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加有上升趋势, 且当添加量为0.3、0.4 g/kg时显著增加了该属的丰度 (P<0.05) ;甲烷球形菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低, 且当添加量为0.3、0.4、0.5 g/kg时显著降低了该属的丰度 (P<0.05) .由此可知, 添加葡萄籽原花青素在门、科、属水平上均对奶牛体外瘤胃产甲烷菌区系有一定的影响.

关键词：葡萄籽原花青素、奶牛、产甲烷菌、Illumina MiSeq测序技术

所属期刊栏目：31

分类号：S823(家畜)

资助基金：国家自然科学基金项目31772629, 31702302;2015年大北农青年教师科研基金;2016年北京农学院青年教师科研基金;2017年北京市教委科技计划项目SQKM201710020011;"十三五"国家重大科技专项2016YFDO700201;北京市农业局北京市现代农业产业技术体系奶牛创新团队

在线出版日期：2019-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：314-323