基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

摘要：

本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序，按照97％的相似度归类操作分类单元（ OTUs），去除序列数量少的OTUs（ n＜2），然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明：1）共获得424062条tags，并归类于1002个非单 OTUs，样品平均 tags 为（28271±8855）条，平均 OTUs 为（261±82）个。2）所有样品共含有20个菌门，160个菌属。其中，共享核心菌门4个，分别是厚壁菌门（85．35％）、变形菌门（6．09％）、蓝细菌门（2．15％）和放线菌门（0．16％）；共享核心菌属19个，占样品微生物总量的93．75％。3）鸡回肠样品预测得出328个功能。从前20个功能热图可知，各样品的效能存在差异。由此可见，鸡回肠微生物群落复杂，但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供了参考依据。

关键词：肉鸡、回肠、高通量测序、核心菌群、PICRUSt

所属期刊栏目：28

分类号：S811.6(普通畜牧学)

资助基金：四川省科技厅国际合作项目2013HH0055

在线出版日期：2016-08-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2581-2588