应用 PCR-DGGE技术比较绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性

摘要：

本研究采用聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳( PCR-DGGE )技术结合DGGE 图谱条带的克隆和测序比较了绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃菌群的多样性,同时对菌群进行了聚类分析和主成分分析。结果表明：绵羊瘤胃、网胃、瓣胃和皱胃内容物DGGE图谱的平均条带数分别为18、13、16和15条；瘤胃和瓣胃内菌群的多样性指数、均匀度和丰富度均较高,分别为2.83、0.79、17.00和2.82、0.79、16.80,而网胃和皱胃内容物较低,分别为2.52、0.70、12.60和2.73、0.76、15.40；聚类分析结果显示不同胃的内容物菌群具有一定差异,但不同动物个体相同胃的内容物相似性系数均高于0.63；PCR-DGGE 图谱中测序的条带大多数归为拟杆菌门( Bacte-roidetes)和厚壁菌门(Firmicutes),优势菌群为厚壁菌门(Firmicutes)细菌、拟杆菌门(Bacte-roidetes)细菌、未培养瘤胃细菌( uncultured rumen bacterium)、未培养细菌( uncultured bacterium)和韦荣球菌科( Veillonellaceae)细菌,特异性细菌为不动杆菌属( Acinetobacter sp.)细菌和瘤胃球菌属( Ruminococcaceae)细菌。结果提示,绵羊4个胃中均含有种类丰富和数量巨大的细菌,且随着消化道部位由前往后的顺序,菌群的多样性呈现先高后降低再升高的趋势。

关键词：绵羊、胃、细菌、PCR-DGGE、聚类分析、主成分分析

分类号：S826(家畜)

资助基金：教育部留学回国人员科研启动基金资助项目200835-1;四川省学术带头人培养基金

在线出版日期：2015-01-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：298-304