基于16S rRNA基因克隆文库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性

摘要：

本研究旨在利用16S rRNA基因克隆库技术分析广西富钟水牛瘤胃产甲烷菌组成及多样性。选取3头体况基本一致的健康雌性富钟水牛作为试验动物,采用机械破壁法提取瘤胃内容物总DNA,采用产甲烷菌引物Met86F/Met1340R扩增16S rRNA基因,构建16S rRNA基因克隆文库。结果表明,本试验共获得93个非嵌合体16S rRNA序列,按照97%的相似性划分为39个分类操作单元( OTU)。其中,60个序列(15个OTU)与已培养细菌16S rRNA序列相似性≥97%,占总序列的64.5%；32个序列(23个OTU)与已培养菌16S rRNA 序列相似性处于90%~(<97%)；仅有1个序列与Methanomassiliicoccus luminyensis相似性<90%。系统发育树分析表明,98.9%的序列均属于甲烷杆菌目( Methanobacteriales),部分序列与Methanobacteriales中任何已知相似序列都相隔较远,它们可能代表Methanobacteriales中新的属或种。由上述结果可见,富钟水牛瘤胃产甲烷菌以Methanobacteriales为优势菌群,其中有许多未知的产甲烷菌需进一步分离培养并对其功能进行分析。

关键词：富钟水牛、瘤胃、产甲烷菌、多样性

分类号：S823(家畜)

资助基金：广西自然基金青年基金项目2012GXNSFBA053070;广西水产畜牧兽医局科技计划项目桂渔牧科1304516;农业部948项目2011-G26

在线出版日期：2014-12-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：3635-3642