2020-2021年新疆地区猪流行性腹泻病毒S基因遗传变异分析

摘要：

为了解新疆地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的遗传变异情况,于2020-2021年从新疆地区规模化猪场采集到326份临床仔猪腹泻病料和肠组织,利用RT-PCR方法对PEDV进行检测,选取部分PEDV阳性样品进行S基因全序列的克隆和测序,并对其序列、遗传进化和抗原表位进行分析.结果显示,326份样品中共有152份样品为PEDV阳性,阳性率为46.6％.选取的11份阳性样品中的PEDV S基因核苷酸(氨基酸)同源性为99.0％～100％(98.2％～99.9％),与GenBank中登录的PEDV参考毒株核苷酸(氨基酸)同源性为92.6％～98.0％(91.2％～97.7％),与经典株CV777核苷酸(氨基酸)同源性为93.1％～93.4％(92.3％～92.7％).遗传进化分析显示,11份阳性样品均位于GIIa亚群,与中国疫苗株CV777处于不同的分群,说明新疆部分地区PEDV流行株与疫苗毒株CV777亲缘关系较远.序列比对结果显示,11份阳性样品中的PEDV S蛋白均存在氨基酸的插入和缺失,中和表位的COE区域变异较大,这可能会降低常规疫苗的免疫保护作用.结果表明,从分子水平明确了2020-2021年新疆地区PEDV的流行与变异情况,为新疆地区PED的防控提供了科学依据.

关键词：猪流行性腹泻病毒、S基因、遗传变异

所属期刊栏目：44

分类号：S852.651;S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：天康生物技术中心项目2019002

在线出版日期：2023-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：16-21