新城疫病毒感染鸡胚组织miRNAs表达谱的测序及分析

摘要：

为了阐明新城疫病毒(NDV)感染鸡胚后miRNAs表达谱的变化及NDV感染与宿主基因之间的相互作用,帮助寻找NDV防控的新靶点和方法.通过small RNA测序技术获得NDV强毒株(F48E9)和弱毒株(La Sota)感染的鸡胚内脏组织miRNAs表达谱.对差异表达的miRNAs进行分析发现,F48E9感染引起了33个miRNAs上调,31个miRNAs下调;La Sota感染引起36个miRNAs上调,25个miRNAs下调;La Sota与F48E9感染组比较,有27个miRNAs上调,22个miRNAs下调.选取10个差异表达miRNAs进行RT-qPCR验证,gga-miR-34a-5p、gga-miR-375、gga-miR-122-3p、gga-miR-187-3p、gga-miR-124a-3p、gga-miR-203a、gga-miR-205a、gga-miR-183、gga-miR-9-3p和gga-miR-451表达量与small RNA测序结果相似.对差异表达miRNAs进行靶基因预测和生物信息学富集分析发现,在NDV感染鸡胚时,差异表达的miRNAs主要参与调控细胞生长代谢、细胞周期及免疫和炎症反应等通路.研究结果分析了NDV感染后miRNAs表达变化及预测功能,为NDV防控研究提供参考.

关键词：新城疫病毒、small RNA测序、miRNA、实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：43

分类号：S852.659.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省自然科学基础研究计划项目;陕西省教育厅一般专项研究计划项目;杨凌职业技术学院博士+高职生工作室建设项目;杨凌职业技术学院自然科学研究项目

在线出版日期：2022-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：19-24