山羊捻转血矛线虫ITS基因序列分析

摘要：

为了解不同年份山羊源捻转血矛线虫内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)基因的遗传变异情况,提取2015年-2020年间陕西省咸阳地区44株山羊源捻转血矛线虫的核糖体DNA(rDNA),对其ITS基因进行扩增、测序与分析.结果显示,44株捻转血矛线虫的ITS-1序列长度为400 bp～404 bp,种内变异率为0～4.1％,与GenBank中英国捻转血矛线虫ITS-1参考序列LS997563的相似性为97.01％～99.75％;ITS-2序列长度为231 bp,种内变异率为0～6.3％,与GenBank中尼日利亚捻转血矛线虫ITS-2参考序列LC368048的相似性为96.97％～100％.结果表明,2015年-2020年间咸阳地区山羊源捻转血矛线虫ITS-1、ITS-2基因均有不同程度的遗传变异,但未出现新的种群分化.此外,基于虫体代表性样本ITS-1、ITS-2序列构建的遗传进化树结果显示,不同国家和地区的分离株进化关系均较为接近,在ITS-1进化树中,只有捻转血矛线虫样本SX17-3与GenBank中陕西ITS-1序列(KX534100)汇于同一支上,在ITS-2进化树中,也只有SX15-8、SX17-9、SX17-113株捻转血矛线虫样本分离株与陕西ITS-1序列(KX534100)距离最近,表明捻转血矛线虫ITS基因序列的变异情况与地理条件之间无明显相关性.

关键词：山羊、捻转血矛线虫、内转录间隔区、序列分析

所属期刊栏目：43

分类号：S852.731;S858.27(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省重点研发计划项目;家畜疫病病原生物学国家重点实验室中国农业科学院兰州兽医研究所开放课题资助项目;西北农林科技大学大学生创新创业训练计划项目;陕西省农业农村厅省级农业专项资金项目

在线出版日期：2022-05-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：42-47