福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析

摘要：

为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测.结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2％(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4).FJ-PCV4的基因组全长为1770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8％～99.2％,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3％～52.0％,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1％～68.2％,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒.研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料.

关键词：猪圆环病毒4型;全基因组;Cap基因;序列分析;系统发育

所属期刊栏目：42

分类号：S852.659.2;Q786(动物医学（兽医学）)

资助基金：福建省科技引导项目;福建省大学生创新创业训练计划资助项目;龙岩学院产学研项目;奇迈基金项目

在线出版日期：2021-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：33-38