成都市猫诺如病毒的检测及VP1基因序列分析

摘要：

为了解四川成都市猫诺如病毒(FNoV)的感染情况,应用公开报道的3对PCR引物对127份临床采集的猫粪便样本(含临床腹泻样本71例,临床健康样本56例)进行FNoV核酸检测,并根据病毒基因片段序列构建遗传进化树.结果显示,采用猫诺如病毒特异性引物FNoV-F9/R15的检出率为9.45％(12/127),高于采用杯状病毒广泛性引物p289d-p290d(2.36％,3/127)及诺如病毒特异性引物JV12Y/13I的检出率(0.79％,1/127).检测发现在临床阳性样本中存在猫泛白细胞减少症病毒(FPV)、猫肠道冠状病毒(FECoV)和猫星状病毒(FAstV)的混合感染.12株临床阳性样本病毒的RNA聚合酶基因序列分析显示,它们与GenBank上提交的猫诺如病毒及狮子诺如病毒处于同一分支,证实为猫诺如病毒.基于VP1基因序列分析结果显示,临床毒株间核苷酸同源性为89.0％?100.0％,氨基酸同源性为96.5％?100％,均位于诺如病毒G1V.2分支.临床毒株可分为2个分支,其中4株与日本毒株(GenBank登录号:LC389583)、美国毒株(GenBank登录号:JF781268)关系紧密;而另外3株则独立聚为1个分支,并存在共有的氨基酸变异位点.结果表明,成都市猫群中存在FNoV的流行,并与其他猫肠道病毒呈现混合感染.采用引物FNoV-F9/R15检测灵敏度高,适用于FNoV的临床检测.由于FNoV基因不断变异,存在临床发病风险,需要对其进行持续监测.

关键词：猫诺如病毒、病毒性腹泻、反转录-聚合酶链反应、VP1基因

所属期刊栏目：42

分类号：S852.659.1;S858.293(动物医学（兽医学）)

资助基金：西南民族大学研究生创新型科研项目;西南民族大学中央高校基本科研业务费专项项目;中央高校基本科研业务费专项项目

在线出版日期：2021-03-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：25-32