鉴定气单胞菌DNA条形码的筛选与评价

摘要：

为筛选合适的DNA条形码对气单胞菌属(Aeromonas)进行鉴定,以33株气单胞菌为材料,选取cpn 60、recA和ppsA 3个候选DNA条形码进行PCR扩增及序列分析.以种间和种内遗传距离、序列扩增测序成功率、DNA条形码间隙(DNA barcoding gap)和系统发育树作为评价条形码片段的指标,筛选出该属的DNA条形码.分析表明,cpn 60基因的扩增及测序的成功率最高,种内遗传平均距离(0.017)和种间遗传平均距离(0.133)差异显著,且存在较明显的DNA barcoding gap,表明cpn 60可作为气单胞菌鉴定的DNA条形码.

关键词：DNA条形码、气单胞菌、遗传距离、DNA条形码间隙

所属期刊栏目：41

分类号：S854.4+4;S852.61+7(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目;广东省教育厅质量工程实验教学示范中心立项项目;广东省大学生科技创新培育专项攀登计划重点项目;广东省基因与蛋白质工程技术研究中心立项项目;中山市社会公益重大项目

在线出版日期：2020-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：55-61