猪德尔塔冠状病毒TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立及应用

摘要：

为建立一种快速、灵敏、准确的猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)分子检测方法,根据PDCoV M基因的保守序列设计并合成引物和探针,建立了PDCoV M基因TaqMan荧光定量PCR检测方法.结果表明,该方法标准曲线具有良好的线性关系,相关系数为0.998;敏感性好,最低可检测到10 co pies/μL的PD-CoV M基因标准品;特异性试验结果显示,该方法与猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪细小病毒(PPV)及大肠埃希菌K88菌株均无交叉反应;重复性试验变异系数低于2％,表明重复性良好.对121份临床样本进行检测,阳性检出率为53.7％(65/121),随机选择10份阳性样品的扩增产物进行测序分析,进一步证实扩增产物中含有PDCoV.该方法具有敏感性高、特异性强、用时短和高通量等特点,适用于PDCoV的定量检测与分子流行病学调查,为PDCoV的准确定量及进一步研究奠定了基础.

关键词：猪德尔塔冠状病毒、M基因、TaqMan探针、荧光定量PCR

所属期刊栏目：40

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：天津市高端兽药先进制造科技重大专项17ZXGSNC00080;天津市现代农业产业技术体系岗位专家项目ITTPRS2017003;天津市农业科学院青年科研人员创新研究与实验项目201912

在线出版日期：2019-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：10-17