陕西省部分地区猪圆环病毒2型全基因组的遗传变异分析

摘要：

为了解陕西省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,根据GenBank登录的PCV2全基因组序列,设计1对引物,从陕西省部分地区规模化猪场疑似PCV2感染的病猪采集病料9份,应用PCR扩增PCV2的全基因,其中6份为阳性,并对扩增的6个PCV2全基因组序列进行测序和序列分析.基因测序表明,PCV2基因组全长为1 767 bp;对6株病毒序列进行同源性比较,6个毒株全基因之间核苷酸同源性为98.3%~100%,与GenBank上已发表的国内外毒株全基因组比较,同源性为96.3%~97.8%;与近几年陕西株比较发现基因变异程度不稳定,与2013年分离株(KX352154.1)同源性最高,2015年分离株(KX352159.1)次之,反而与2014年分离株(KX068219.1)最低;对6个毒株的ORF1和ORF2基因进行同源性比较,6个毒株的ORF1和ORF2基因的核苷酸同源性分别为98.1%~100%和98.2%~100%,与GenBank上已发表的国内外参考株ORF1和ORF2基因进行同源性比较,同源性分别为97.6%~99.8%和91.5~96.0%.陕西省流行的PCV2基因组较为保守,变异不大,同源性很高.

关键词：猪圆环病毒2型、全基因、序列分析

所属期刊栏目：38

分类号：S852.659.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：陕西省农业科技创新与攻关项目2016NY-095;西北农林科技大学基本科研业务费项目Z109021427

在线出版日期：2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：22-26