A 型产气荚膜梭菌青海分离株α毒素基因分析及其蛋白结构与抗原表位预测

摘要：

应用PC R技术对A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因进行扩增，并进行测序，利用生物软件对α毒素基因序列进行分析，对蛋白结构、B细胞抗原表位进行预测。结果表明，A型产气荚膜梭菌青海分离株的α毒素基因长度为1110 bp ，编码370个氨基酸。与参考菌株T0、S16、NRRLB-23744、KZ211和CER89L1216的α毒素基因核苷酸序列同源性依次为99．9％、99．9％、99．9％、99．9％和99．7％，氨基酸序列同源性均为100％。综合α毒素蛋白亲水性、表面可能性、抗原指数及二级结构预测结果显示在26-29、71-78、111-114、182-185、189-192、264-268、272-275、282-285、294-297、362-365位氨基酸残基存在可能的B细胞抗原表位，结合三级结构预测结果显示，α毒素294位-297位氨基酸残基形成表位并结合抗体的可能性较高。研究结果可为A型产气荚膜梭菌表位疫苗的设计与研制提供基础。

关键词：A型产气荚膜梭菌、α毒素、序列分析、表位、蛋白结构

分类号：S852.616.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目31160511；青海省科技厅项目2012-Z-930Q；青海省外专局项目H20126300013

在线出版日期：2014-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：12-18