猪流行性腹泻病毒PCR检测及其M基因的遗传变异分析

摘要：

为了解我国猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行情况,利用套式反转录-聚合酶链反应(nRT-PCR)技术,从表现腹泻症状的仔猪粪便中扩增出6份阳性样品,测序表明,一扩PCR产物的大小为854 bp,涵盖PEDV的M基因.选择34个参考毒株基于M基因进行进化树分析,结果显示PEDV可以分为G1和G2两个基因型7个基因亚型.G1型以2007年前的经典毒株为主,包括CV777、Br1/87、KPEDV-9、JMe2和CH/S株等；G2型则以近年分离的毒株为主,包括GDXS5、JS-2004-2、PFF188、KU06RB08等.其中G2.3亚型已经成为目前世界上主要的PEDV流行毒株,包括本次检测的6株PEDV、泰国的KU06RB08及GenBank中我国和韩国2011年的流行毒株.通过同源性比较发现,这6株PEDV之间的同源性为98.2％～100％,与经典毒株CV777的同源性为97.6％～98.2％.结果表明,尽管PEDV之间的同源性仍较高,但PEDV流行毒株已经逐渐形成独特的流行进化分支.

关键词：猪流行性腹泻病毒、M基因、进化分析

所属期刊栏目：34

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家支撑计划项目2007BAD86B05;广西科技攻关课题桂科攻0815009-3-9

在线出版日期：2013-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：13-18