一株鸭源H3N6亚型禽流感病毒遗传进化分析

摘要：

从活禽交易市场健康鸭体内分离到一株H3N6亚型禽流感病毒,命名为A/Duck/Guangdong/E9/2012(H3N6),这是该亚型禽流感病毒在我国广东地区的首次分离报道.为分析其遗传进化特征,对该病毒全基因组序列进行了测定,进行了遗传进化分析.结果显示,其HA裂解位点附近的氨基酸序列为PEKQTR↓ GLF,只含有1个碱性氨基酸,符合低致病性禽流感病毒的HA裂解位点氨基酸序列的分子特征；其HA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7457/2011(H3N5)禽流感病毒的HA基因同源性最高,其NA基因与2011年蒙古国分离的鸭源A/Duck/Mongolia/OIE-7438/2011(H4N6)禽流感病毒的NA基因同源性最高.全基因组分子遗传进化分析结果显示,其8个基因均属于欧亚谱系的禽源进化分支.

关键词：禽流感病毒、H3N6、基因组序列分析、分子遗传演化

所属期刊栏目：34

分类号：S852.659.5;Q789(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家肉鸡产业技术体系项目nycytx-42-G3-03;广东省自然科学基金项目10251064201000004;国家自然基金项目31172343;广东省科技计划项目2012B020306003,2010B020307005;2010年度广东省高等学校高层次人才项目

在线出版日期：2013-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：17-24