10.3969/j.issn.1007-5038.2011.10.007
桂林蛇源裂头蚴分离株的分子鉴定及种系发育关系分析
为研究从桂林草花蛇中分离到的裂头蚴的分子分类地位,对其核糖体18 S rDNA、28 S rDNA、ITS全基因及线粒体coxl部分基因进行了克隆和序列分析.从GenBank获取相应基因序列,应用CLUSTAL W2软件进行多重比对分析序列差异,应用MEGA 4.0软件构建种系发育树.结果表明,在基于18 S、28 S基因序列构建的种系发育树中,本株裂头蚴分别与欧猥迭宫绦虫(D64072) 18S构成一个单独分支,自展值为100%;与拟曼迭宫绦虫(AF004718)、欧猥迭宫绦虫(AF004717)、无头蚴绦虫(AF096223)28 S同属一个分支,自展值61%.基于ITS1、ITS2和coxl部分基因序列构建的种系发育树与所有欧猥迭宫绦虫均构成同一亚群,总分支自展值分别为100%、99%、64%,三者在不同的分离株之间呈现基因多态性,从总分支自展值来看coxl比ITS更适合用于种内遗传多态性研究,ITS适合做定种的分子标记.
裂头蚴、小亚基、大亚基、内转录间隔区、细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基
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S852.71(动物医学(兽医学))
国家质检总局科技专项20101K013
2012-02-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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