猪流感病毒H1N1广东分离株HA基因的克隆与进化分析

摘要：

采用常规的血清学试验和特异性RT-PCR,从广东不同地区猪场分离鉴定出8株H1N1亚型猪流感病毒(SIV).用流感病毒血凝素(HA)基因通用引物扩增了8株病毒的血凝素(HA)基因,经克隆测序,HA基因全长1 757 bp,编码566个氨基酸.8个毒株的HA基因推导氨基酸序列分析表明,均含有8个潜在的N糖基化位点,且糖基化位点相同,其HA1、HA2之间切割位点序列为IPSIQSR↓G,从分子水平推论,此8株H1N1 SIV均属于非高致病性毒株.同源性分析表明,此8株病毒的氨基酸序列与经典SIV之间的同源性在92.3%～94.7%之间;与2009年甲型H1N1流感病毒同源性在80.4%～92.4%之间;与欧洲类禽SIV分离株同源性在80.4%～84.1%之间.进化关系表明,该8株SIV与A-swine-Shanghai-3-2005-H1N1同处一分支,与2009年甲型H1N1流感病毒和经典SIV分离株亲缘关系较近,与欧洲类禽SIV分离株亲缘关系较远.

关键词：甲型H1N1流感病毒、猪流感病毒、HA基因、进化分析

所属期刊栏目：31

分类号：S852.659.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：广东省重大科技专项项目2006A20901003

在线出版日期：2011-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-18