猪脑心肌炎病毒GXLC株VP1基因的克隆与序列分析

摘要：

应用RT-PCR方法扩增猪脑心肌炎病毒GXLC株的VP1基因,扩增产物克隆入pMD 18-T载体后进行测序,对获得的VP1基因序列进行分析.序列分析表明,GXLC株VP1基因长度为831 bp,编码277 aa,含有2个潜在的N-糖基化基序和9个抗原表位.同源性分析表明,GXLC株与国内外其他26个EMCV分离株VP1基因核苷酸序列的同源性在78.6%～99.6%之间、氨基酸序列的同源性在95.1%～99.3%之间.遗传进化分析表明,基于VP1基因序列绘制的系统进化树可以将所有EMCV分离株分成两个群,即Ⅰ群和Ⅱ群,Ⅰ群可再细分为Ⅰa亚群和Ⅰb亚群,其中猪源、鼠源EMCV在Ⅰ群和Ⅱ群中均有分布,人源EMCV则分布在Ⅱ群;GXLC株与其他中国分离株均属于Ⅰa亚群.

关键词：猪、脑心肌炎病毒、VP1基因、分子特征

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分类号：S852.659.6;Q786(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西科学基金项目桂科青0728047;广西科技创新能力与条件建设基金项目08-05-01D

在线出版日期：2010-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：45-50