新城疫病毒云南分离株F基因变异特性分析

摘要：

采用RT-PCR技术对云南2007年-2009年采集的948份喉气管拭子或组织样品中新城疫病毒F基因进行检测,获得阳性样品65份,选择30份代表性阳性样品采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序.序列比对及系统发育分析结果表明,新城疫病毒云南分离株F基因核苷酸与疫苗LaSota株之间的同源性为70.5%～99.8%,与F48E9株之间的同源性为70.7%～90.8%.系统发育分析表明,30株病毒中21株属于基因型Ⅶ,裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F,与传统认为强毒裂解位点氨基酸序列相同;7株属于基因型Ⅱ,5株裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L,属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征,2株裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F属于强毒裂解位点氨基酸序列;2株病毒与9个基因型的同源性差异较远.

关键词：新城疫病毒、F基因、序列分析、基因型

所属期刊栏目：31

分类号：S852.659.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：云南省科技攻关项目2006NG-24;云南省后备人才基金项目2009CI061;云南省高层次科技人才培引工程20080C002;农业部农业公益性行业科研专项200803026

在线出版日期：2010-07-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：14-18