广西高致病性 PRRSV Nsp2基因的克隆、序列分析和抗原表位预测

摘要：

根据猪繁殖与吸吸综合征病毒(PRRSV)VR2332 Nsp2基因序列合成特异性引物,对广西分离的高致病性PRRSV进行RT-PCR扩增,将扩增出的796 bp片段插入pMD18-T载体中进行序列测定和分析,并用DNA Star软件对Nsp2基因推导的氨基酸序列进行了表位分析.结果显示,广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因第483位和第532位～第560位氨基酸发生缺失,核苷酸序列之间的同源性为97.0%～97.4%,推导编码的氨基酸序列之间的同源性为93.6%～94.7%;与PRRSV VR2332株、MLV株和CH-1a株核苷酸之间的同源性分别为79.0%～79.2%、78.8%～78.9%和88.2%～89.3%;氨基酸之间的同源性分别为59.4%～60.2%、59.4%～60.2%和70.9%～81.6%,表明广西3个县、市的PRRSV分离株Nsp2基因与VR2332株、MLV株和CH-1a株比较变异较大.表位分析表明,由于博白株的Nsp2基因的第532位～560位氨基酸的缺失,与VR2332株比较,其亲水性、抗原指数均发生了大的变化.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、Nsp2基因、克隆、序列分析

所属期刊栏目：29

分类号：S852.659.6;S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家百千万人才工程人选专项资金945200603

在线出版日期：2008-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1-4