O型口蹄疫病毒VP1基因区序列系统发育树分型

摘要：

从GenBank和世界口蹄疫参考实验室基因库(WRLFMD)下载O型FMDV全VP1序列共210条,其中23条为已知基因型序列,其他为未知基因型序列.利用分子生物学软件DNA Star中的ClustalW和TreeView工具,以已知基因型的VP1区序列构建系统发育树,验证分型结果与已知基因型是否一致.然后以已知基因型序列作为参照,将未知基因型序列与已知基因型序列一起构建系统发育树,以已知基因型序列在系统发育树中所处的位置,来判断未知基因型序列的归属,从而明确它们归属于何种基因型.结果表明,采用此种分型方法获得Cathay型74条、SEA型24条、EA型4条、WA型4条、Euro-SA型21条、ME-SA型68条、ISA-1型3条、ISA-2型2条,未能分型序列10条.

关键词：O型口蹄疫病毒、基因型/拓扑型、系统发育树、VP1基因

所属期刊栏目：28

分类号：S852.659.6;Q754(动物医学（兽医学）)

资助基金：北京市自然科学基金6062009

在线出版日期：2007-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：8-13