齿缘摄龟线粒体基因组全序列与系统进化

摘要：

采用常规PCR扩增并测序获得了齿缘摄龟(Cyclemys dentata)线粒体DNA(mtDNA)全序列,并研究了其基因组结构特点;根据20种龟的线粒体基因组重链蛋白编码基因序列,分别利用最大简约法(MP)、最大似然法(ML)和贝叶斯法(Bayesian)构建系统进化树,探讨这些龟鳖物种之间的系统进化关系.结果显示,齿缘摄龟线粒体基因组全序列长为16 489 bp(GenBank登录号为JX455823),A+T含量为61.51％,编码37个基因,包括13个蛋白质编码基因,2个rRNA,22个tRNA和1个控制区(D-loop),基因组成与其他龟鳖类动物相似;非编码区D-loop长973 bp,包含1个中央保守区(CD),2个扩展终止结合序列区(ETASs),3个保守盒(CSBs);构建的MP树、ML树和Bayesian树的拓扑结构相似,闭壳龟属7种龟聚为一枝,拟水龟属6种龟聚为一枝,齿缘摄龟与黑桥摄龟聚在一枝,3种进化树均支持这些龟鳖物种现有的分类学地位.

关键词：齿缘摄龟、线粒体全基因组、系统进化关系

所属期刊栏目：49

分类号：Q951(动物学)

资助基金：广西水产畜牧兽医局专项项目桂渔牧财[2011]52号,桂渔牧财[2012]30号;

在线出版日期：2014-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：536-545