鲤TRAP分子标记反应体系的建立与优化

摘要：

针对鲤(Cyprinus carpio)这一主要水产养殖品种设计了靶位区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,TRAP)分子标记的反应体系,对影响TRAP反应体系的各参数,包括Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、模板DNA和引物浓度进行了优化,建立了适合鲤的、稳定、可重复的TRAP-PCR反应体系.在15 μl PCR反应体系中,Mg2+浓度为1.5 mmol/L、dNTPs浓度为0.35 mmol/L、两个随机引物浓度均为3 pmol/L、固定引物浓度为10 pmol/L、含DNA模板60 ng、Taq DNA聚合酶1.0 U.鲤的TRAP反应程序为:94℃4 min,1个循环;940C 45 s,35℃ 45 s,72℃ 1 min,5个循环;94℃ 45 s,53℃ 45 s,72℃1 min,35个循环;72℃10 min,1个循环.这一优化体系的建立为今后进行鲤群体遗传多样性、种质鉴定、遗传连锁图谱及亲缘关系分析等方面的研究提供了新的分子标记.

关键词：鲤、TRAP标记、体系、优化

所属期刊栏目：45

分类号：Q953(动物学)

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项资金项目nycytx-49;国家"十一五"科技支撑计划项目专题2006BAD01A1208;农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放课题BZ2009-06

在线出版日期：2010-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：72-78