Discovery Studio2.0的模块扩展及应用:残基水平非键相互作用能量的自动批量计算
非键相互作用对于生物体系中的分子识别和结合过程起着关键作用.然而,传统的方法并不能在残基水平自动批量计算非键相互作用.近年来,已经发展了一些方法和工具进行非键相互作用的计算分析.该文研究发展了一种可以自动计算残基间非键相互作用的方法,即用Perl脚本调用Discovery Studio 2.0(DS2.0,Accelrys Inc.)底层模块中的非键相互作用协议,实现了直接利用命令行批量计算非键相互作用能量,而无需通过DS2.0的图形界面.该方法扩展了DS2.0的计算模块,并于近期运用到了复合结构的研究分析中.
非键相互作用、模块扩展、Discovery Studio 2.0
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Q5-3;Q811.4;TP399
国家重点基础研究发展计划项目"973"2009CB941302;国家自然科学基金项目30470939;30623007;中国科学院基金项目2007211311091
2011-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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