腹泻仔猪中猪圆环病毒2型的检测及生物信息学分析

摘要：

为研究仔猪腹泻中猪圆环病毒2型(PCV2)的生物信息,参考GenBank发表的猪圆环病毒2型(PCV2)全基因组序列,设计并合成一对特异性引物,从四川地区猪场送检的腹泻仔猪病料中扩增PCV2全长基因序列,回收PCR产物.将其插入PMD19-T载体,构建了重组质粒,转化后筛选、提取阳性重组质粒进行测序.将测序结果及推导的氨基酸序列与国内外的不同分离株进行生物信息学分析.结果表明,分离株基因组全长为1 767 bp,分离的三株基因组与GenBank上已发表的PCV2分离株之间的核苷酸同源性分别为1#94.7％～89.6％、2#94.7％～89.3％.3#96.4％～86.8％,氨基酸序列同源性为1#97.9％～95.7％、2#97.1％～95.5％、3#98.4％～94.8％,说明四川地区腹泻仔猪病料中PCV2的变异相对保守.

关键词：猪圆环病毒2型、PCR检测、生物信息学分析

所属期刊栏目：34

分类号：S85;TS2

资助基金：四川省科技支撑计划2014NZ0043,2015NZ0072

在线出版日期：2018-01-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：95-99