10.3969/j.issn.1000-6907.2020.03.003
白斑狗鱼雌、雄基因组混池重测序研究
为研究白斑狗鱼(Esox lucius)雌、雄基因组差异,实验对20尾雌鱼和20尾雄鱼分别进行混池重测序.测序结果显示:雌、雄池待分析测序数(clean reads)分别为282400688条和277391000条,碱基测序错误率(Q30)为94.44％和93.98％.经过与参考基因组比对分析,得到2076647个雌性SNP和2076942个雄性SNP;105810个雌性Indel和647466个雄性Indel;具有显著性别特异的SNP位点10个;使用SNP-Index算法筛选出性别特异区域26个.对雌、雄基因组进行比对和组装分析,分别获得雌、雄特异序列524条和500条.选择116条雌性和160条雄性特异序列进行PCR验证,得到一条长度为773 bp具有雄性偏向性的序列.
白斑狗鱼(Esox lucius)、混池重测序、SNP、Indel、性别特异序列
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S917.4(水产基础科学)
新疆维吾尔自治区高校科研计划项目;国家自然科学基金
2020-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
17-25
