大口黑鲈组织蛋白酶B基因SNP筛选及其与生长性状关联分析

摘要：

在动物体内组织蛋白酶B(cathepsin B,CTSB) 是以酶原形式存在于溶酶体中,能水解多种蛋白,是调控动物生长发育的重要候选功能基因.为开发与大口黑鲈(Micropterus salmoides)生长性状相关的单核苷酸多态性(sin-gle nucleotide polymorphism,SNP) 标记,本研究对大口黑鲈EST-SNP库中CTSB基因上的SNP位点进行筛选.经PCR扩增和测序分析,从该基因中筛选到1个SNP位点(命名为C+598G),该位点属于错义突变位点,编码的甘氨酸突变成为精氨酸.采用SnaPshot方法对C+598G位点在165尾大口黑鲈养殖样本中的基因型进行检测,并分析其在群体中的遗传多样性.结果显示,C+598G位点在养殖群体中存在CC、GC和GG3种基因型,其频率分别是40.6%、47.3%和12.1%, C和G等位基因频率分别是64.2%和35.8%;该位点在群体中的观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为0.473和0.354,符合哈代-温伯格平衡定律.进一步分析不同基因型与大口黑鲈生长性状相关性,结果表明,3种基因型个体的体质量、全长、体高、尾柄长和尾柄高性状平均值从小到大依次为GG型、GC型和CC型,其中GG型个体在体质量上显著小于CC型个体(P<0.05).本研究获得的C+598G标记与大口黑鲈生长性状显著相关,可作为大口黑鲈分子标记辅助育种研究中的生长标记.

关键词：大口黑鲈(Micropterus salmoides)、组织蛋白酶B、单核苷酸多态性、生长性状、关联分析

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分类号：S917(水产基础科学)

资助基金：南京市高端人才团队引进计划项目2016;浙江省农业水产新品种选育重大科技专项2016C02055-3;渔港建设和渔业产业发展专项A201601A12;广东省科技计划项目2016A020210020

在线出版日期：2018-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：39-42