基于线粒体Cytb基因和D-loop区序列的高邮湖湖鲚(Coilia nasus)遗传多样性分析

摘要：

本研究利用线粒体细胞色素b(Cytb)基因和控制区(D-loop)序列作为分子标记,调查了高邮湖湖鲚(Coilianasus)种群遗传多样性.结果显示,Cytb基因和D-loop区序列碱基A+T含量均高于G+C含量,显示碱基组成具有偏倚性.38条Cytb基因序列检出26个变异位点,定义13个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.716±0.078和0.002 70±0.000 57;40条D-loop区序列检出53个变异位点,定义21个单倍型,单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.906±0.034和0.006 27±0.000 99.13个Cytb基因单倍型之间的遗传距离在0.001～0.014之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为1支;21个D-loop区单倍型之间的遗传距离在0.001～0.019之间,NJ系统进化树显示单倍型聚为2支.中性检测结果和歧点分布图均表明高邮湖湖鲚种群稳定,近期没有发生种群扩张.整体来看,高邮湖湖鲚种质资源遗传多样性水平较高,具有高单倍型多样性和低核苷酸多样性的特征.

关键词：湖鲚(Coilia nasus)、遗传多样性、线粒体DNA、细胞色素b基因、控制区序列

所属期刊栏目：47

分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：江苏省海洋与渔业资源环保项目“江苏省水生生物资源重大专项ZYHB16-3”

在线出版日期：2018-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：3-8