软刺裸鲤和齐口裂鳆鱼HIF1 B和HIF2 A的克隆及低氧适应性的表达分析

摘要：

获得高原软刺裸鲤(Gymnocypris dobula)和齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)HIF1B和HIF2A基因cDNA完整的开放阅读框(ORF), 并进行氨基酸序列分析; 采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术, 检测了 HIF1B和HIF2A在两种裂腹鱼体内各组织中的表达, 以及应激性低氧条件下罗非鱼不同组织中的表达. 基因序列分析结果显示,软刺裸鲤和齐口裂腹鱼HIF1B基因长度分别为2 322 bp和2 313 bp, 预测编码773和770个氨基酸; HIF2A基因长度分别为2 466 bp和2 502 bp, 预测编码821和833个氨基酸. 同源分析显示, 齐口裂腹鱼和软刺裸鲤HIF1B ODD结构域氨基酸序列同源性为93. 12%, HIF2A为89. 56%. 在CODD保守结构域中,软刺裸鲤HIF1B的Lxx-LAP位点突变成PxxLAP,这可能是高原裂腹鱼HIF1B功能进化的重要标志. 定量检测结果表明,在应激性低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达上升;而在长期低氧环境中,硬骨鱼类鳃和皮肤中HIF1B和HIF2A mRNA的表达下降,推测硬骨鱼体内可能存在两种不同的机制来适应长期低氧和应激性低氧环境.

关键词：裂腹鱼类、低氧环境、HIF1B、HIF2A、基因克隆、进化

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分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金重点项目31130049;教育部科学技术研究项目213013A;上海市教委科研创新项目曙光计划13SG51;上海市教委水产学一流学科项目

在线出版日期：2015-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：11-18