TLR9基因SNP位点检测及其在7种鲤中的遗传多样性研究

摘要：

采用直接测序法对7种鲤(Cyprinus carpio):德国镜鲤(C.carpio L.mirror)、松荷鲤(C.carpio L)、松浦鲤(C.carpio var.Songpu)、易捕鲤(C.carpio var.Yibu)、大头鲤(C.pellegrini T.)、松浦镜鲤(C.carpio var.Songpu mirror)和野鲤(C.carpio haematoperus)TLR9基因的SNP位点的多态性和遗传多样性进行了研究.结果显示,在292个个体中共检测出37个碱基变异位点,均位于基因外显子区域,占整个片段长度的0.84％,其中20个SNP位点为非同义突变.野鲤的碱基突变位点最多,松浦镜鲤的碱基突变位点最少(P＜0.05),其他各品种间无显著性差异(P＞0.05);野鲤的非同义突变位点最多,松浦镜鲤的非同义突变位点最少(P＜0.05),其他各品种间无显著性差异(P＞0.05).稀有等位基因频率大于0.05时,经Hardy-Weinberg卡方检验结果显示各品种中除了德国镜鲤和松浦镜鲤外,大多数位点都处于平衡状态(P＞0.05);各品种的PIC值处于中低度多态水平(PIC＜0.5).卡方检验分析结果显示,各品种间共有24个位点的基因型频率存在显著性差异(P＜0.05),其中11个位点为非同义突变位点,这可能是影响TLR9基因免疫应答功能的原因.

关键词：TLR9基因、SNP、鲤(Cyprinus carpio)、遗传多样性

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分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：资助项目:国家“863”计划2011AA100402;公益性行业农业科研专项200903045;黑龙江省自然科学基金项目C201044;黑龙江省科技攻关项目GZ11B203;现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-46-02;国家科技支撑计划2012BAD26B01

在线出版日期：2013-12-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：19-28