玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因多态性与组织表达分析

摘要：

以cDNA为模板进行PCR扩增和克隆分析,从7尾玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.wananensis)的70个有效克隆中,获得长度为624 bp的MHC Ⅱ α/β不同编码序列25/31个,分属于7/10个不同等位基因,揭示玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因的多态性仍较丰富.其中Cyca-DXA17*01和Cyca-DAB1*1201、Cyca-DAB1*1301、Cyca-DAB3* 1901、Cyca-DAB3* 2001、Cyca-DAB3* 2101、Cyca-DAB3* 2201为新发现的7个基因.分析表明,α1/β1结构域的核苷酸/氨基酸变异位点数明显高于α2/β2结构域；α1、β1结构域抗原结合位点(PBR)的ω值(ω=dN/ds,5.209和1.703)都大于1,揭示玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因在进化过程中受到正向选择作用.半定量分析显示,玻璃红鲤MHC Ⅱ类基因在肾和脾中有较强表达,中等程度表达于胃、肝和肠,而鳃、心和眼的表达较弱.

关键词：玻璃红鲤(Cyprinus carpio var.wananensis)、主要组织相容性复合体(MHC)、多态性、组织特异性表达

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分类号：S917.4(水产基础科学)

资助基金：农业部公益性行业科研专项200903045;上海市教育委员会科研创新基金11YZ152;上海市水生生物学重点学科建设项目S30701

在线出版日期：2013-07-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：15-20