鲫体重和体厚相关的EST-SSRs标记筛选及同源基因分析

摘要：

利用300个EST-SSRs标记对普通二倍体鲫(Carassius auratus)自交F2代的181个个体进行基因型检测,并对其体重、体厚两种经济性状进行单标记回归分析.Permutation检验(10 000次)结果显示,38个标记与所检测的经济性状相关,其中26个标记达到显著性相关(P＜0.05),12个标记达到极显著性相关(P＜0.01).在38个相关标记中,有27个标记与体重相关,25个标记与体厚相关,14个标记与体重、体厚均相关.对同一标记的不同基因型之间进行多重比较,找到了与两种经济性状相关的基因型.将与性状相关的38个标记与斑马鱼(Danio rerio)基因组序列进行BLAST同源性比对,找到10条相似性高且功能已知的EST-SSRs序列(E＜e-20).其中,JE594与斑马鱼膜结合环指蛋白基因march7相似性高达95％,JE3165与斑马鱼肌盲蛋白基因mbnl1的相似性达78％,JE6996与斑马鱼促蛋白激酶的基因mapk10的相似性高达98％,JE4984与斑马鱼蛋白磷酸酶的基因ppp1cab相似性达84％.本研究筛选出了与鲫体重、体厚相关的EST-SSRs标记及基因型并找到了与鲫生长相关的候选功能基因,为鲫的分子标记辅助育种(MAS)及目标性状的遗传改良提供依据.

关键词：鲫(Carassius auratus)、EST-SSRs、体重、体厚、同源比对

所属期刊栏目：43

分类号：S917.4;Q959.468.03(水产基础科学)

资助基金：公益性行业农业科研专项200903045;国家973计划项目2010CB126305;农业部948计划项目2011-G12

在线出版日期：2013-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：9-15