草鱼EST - SSRs标记的筛选及其与生长性状相关分析

摘要：

利用草鱼(Ctenopharyngodon idella)EST( expressed sequence tags)数据库开发的18个EST - SSR标记,对草鱼群体进行基因型与生长性状关联分析和群体遗传多样性分析,结果表明:关联分析得到6个微卫星位点(13118、13305、24017、25085、35939和40698)与体重,体长和体高显著或极显著相关(P ＜0.05或P＜0.01).对其进行多重比较获得有利基因型分别为13118位点的BB、13305位点的AD、24017位点的AC、25085位点的BE、35939位点的BB和40698位点的BB.将6个微卫星位点上的EST序列与GenBank数据库进行BLAST比对,其中24017序列与鲤鱼自然杀伤细胞增强因子(NCEF)同源性水平高达86％,25085序列与草鱼反应元件结合蛋白(CREB)的基因同源性水平达到80％.应用这18个微卫星位点对草鱼养殖群体进行遗传多样性分析,共检测到82个等位基因,平均等位基因4.556个,每个位点检测到的等位基因数为2～9个,群体的平均观测杂合度为0.452 9,平均期望杂合度和平均多态信息含量分别为0.457 1和0.401 7,表明该群体遗传多样性处于低水平.

关键词：草鱼、EST-SSR、生长性状、关联分析、遗传多样性

所属期刊栏目：42

分类号：S917;Q311+.8(水产基础科学)

资助基金：现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-46-03;国家高技术研究发展计划2011AA100403;佛山市三水区科技计划项目;农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室开放基金

在线出版日期：2012-05-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：3-8,29