鳜肌肉组织cDNA文库构建及其ESTs分析

摘要：

以鳜(Siniperca chutasi)肌肉为实验材料,采用非均一化引物定向克隆技术构建了鳜肌肉组织cDNA文库,并进行大规模EST测序和序列分析.结果显示,cDNA文库的库容量为2.3×105,重组率达96.5%,平均插入片段长度为1.2 kb.随机挑选5456个克隆,成功测序5191个,其中高质量序列5063个,达97.5%.利用PHRAP程序聚类拼接后,得到1625条非冗余序列,包括443个重叠群(Contigs),1182个单拷贝(Singlets).使用BLAST软件将这些序列同GenBank等数据库进行比对、注释,发现1625个非冗余序列与鳜肌肉结构和发生相关,而其中991条序列与NCBI数据库中的其它物种已知序列存在显著的相似性,剩余的634条非冗余序列(占所有非冗余序列的39%)为在鳜中新发现的未找到同源序列的序列.740个基因为能够注释到Gene ontology(Go)中的序列数目.

关键词：鳜(Siniperca chutasi)、肌肉、cDNA文库、EST

所属期刊栏目：39

分类号：S917;Q785(水产基础科学)

资助基金：国家自然科学基金面上项目30771644;湖南省自然科学基金项目09JJ6037,08JJ064

在线出版日期：2009-11-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：29-33