草鱼胞质苹果酸脱氢酶(cMDH)的序列克隆及分析

摘要：

以实验室构建的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道cDNA文库苹果酸脱氢酶(cMDH)EST序列为基础,采用末端快速扩增法(RACE),从健康雌性草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肠道细胞RNA中获得1391 bp的草鱼肠道cMDH的cDNA序列(NCBI登录号:EU569765).结果显示:该序列包含62 bp的5'非编码区(5'-UTR),330 bp的3'非编码区(3'-UTR),典犁加尾信号AATAA位于polyA起点上游16 bp.开放阅读框ORF长999 bp,共编码333个氨基酸,预测蛋白等电点为6.67,大小为36 kDa.多序列比对显示草鱼胞质苹果酸脱氢酶具有典型的苹果酸脱氢酶功能区保守序列,该酶与斑马鱼cMDH相似度最高达到95.5%,与模式植物拟兰介的相似度为57.8%,其预测三级结构具有典型cMDH功能区.Southern杂交结果表明草鱼cMDH属于多拷贝基因家族.

关键词：草鱼(Ctenopharyngodon idellus)、肠道、胞质苹果酸脱氢酶、cDNA、克隆、序列分析

所属期刊栏目：38

分类号：S917;S965.112(水产基础科学)

资助基金：通威股份公司科技发展项目一草鱼基因组计划及产业化项目基金;四川省科技攻关项目05NG002-002-4

在线出版日期：2008-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：66-72