汉滩病毒Gc的细胞免疫反应性评估和验证

摘要：

目的 筛选、鉴定并验证汉滩病毒包膜糖蛋白C末端(Hantaan virus glycoprotein C-terminal,HTNV Gc)上免疫反应性表位.方法 在预测覆盖率超过全球98％人群主要组织相容性复合物(major histocompatibility complex,MHC)基因基础上,通过免疫表位数据库(Immune Epitope Database,IEDB)、丹麦技术大学(Technical University of Denmark,DTU)等免疫信息学前沿算法系统分析HTNV Gc上9肽和15肽表位的亲和力,使用Vaxijen工具分析免疫原性,使用Blastp工具分析种间种内保守性;双向层次聚类比较MHC-Ⅰ类和Ⅱ类限制性表位的交叉免疫反应性;使用分子对接模拟出优势表位与MHC对接的可能结果;通过酶联免疫斑点(ELISpot)实验验证计算机分析结果.结果 将多种生物信息学算法结果整合后,获得高亲和力、种间种内保守和强免疫原性的9肽和15肽表位,分别为8和80个,其中人鼠共同优势表位8个;聚类分析证明H-2基因型与HLA基因型存在部分相似;分子对接结果模拟出下优势表位与多个MHC基因型对接良好,且与亲和力分析结果一致;在非优势表位对比下,优势表位组小鼠脾细胞分泌IFN-γ的量更高.结论 使用多种生物信息学算法成功筛选出HTNV Gc上优势表位,并通过ELISpot实验鉴定了上述表位的细胞免疫反应性.

关键词：汉滩病毒、糖蛋白、表位、计算机预测、免疫反应性

所属期刊栏目：45

分类号：R373.32;R392.2;R394-33(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

在线出版日期：2023-10-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2007-2017