8-自噬相关lncRNA模型在预测膀胱癌患者预后中的作用

摘要：

目的 探究自噬相关lncRNA风险预测模型在膀胱癌患者中的潜在预后作用与价值.方法 从TCGA数据库中获取膀胱癌患者的转录组数据和相应的临床资料.通过R软件将402例膀胱癌样本按3:1的比例随机分为训练集及验证集.通过Pearson相关性分析筛选自噬相关lncRNA,并通过单因素和多因素Cox回归分析构建自噬相关lncRNA预后模型.通过绘制ROC曲线评估模型的准确性.进一步计算样本风险评分并分析其与患者临床特征、生存预后的关系.另外通过构建列线图评估该模型对膀胱癌患者预后的预测能力.最后,通过GSEA分析不同风险分组可能富集的KEGG通路.采用RT-qPCR验证模型中高危lncRNA的表达情况.结果 成功构建了一个8-自噬相关lncRNA模型,在训练集、验证集和总体集中,该预后模型ROC曲线的AUC值均大于0.75.模型风险评分与患者年龄、MCC分期和T分期有关(P＜0.05),与患者性别无明显关系.通过整合临床变量和风险评分建立的列线图证实该模型具有良好的预后预测能力.GSEA分析显示,一些肿瘤和自噬相关通路在高风险组富集,而免疫相关通路在低风险组富集.模型中lncRNA AC005229.4在膀胱癌细胞系中高表达.结论 8-自噬相关lncRNA模型对膀胱癌患者的预后具有较好的预测效能.

关键词：膀胱癌;生物信息学;自噬;lncRNA;预后模型

所属期刊栏目：43

分类号：R181.23;R730.7;R737.14(流行病学与防疫)

在线出版日期：2022-01-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：2532-2541