DOI:10.16016/j.1000-5404.201602049扎伊尔型埃博拉病毒型特异性标签序列鉴定及其荧光定量PCR检测引用分享分享到微信朋友圈打开微信,点击底部的“发现”,使用 “扫一扫” 即可将网页分享到我的朋友圈收藏摘要:目的 建立一种快速准确检测扎伊尔型埃博拉病毒(Zaire ebola virus,ZEBOV)的方法.方法 以2014年西非新分离的3株ZEBOV全基因组参考序列及1976年从Mayinga分离的ZEBOV株(NC_002549)为目标,基于Insignia系统算法与GenBank中Nt库比对,求出ZEBOV特异性核酸标签序列.设计引物、TaqMan探针和优化反应条件,以10倍系列稀释的阳性质粒做标准曲线,做准确性、重复性实验.并以其余4个亚型的埃博拉病毒、马尔堡病毒、西尼罗河热病毒、东方马脑炎病毒、西方马脑炎病毒等8种病毒对照及临床48例患者复杂样本为对照做特异性检测.结果 选择比对得到的特异性标签序列(KJ660348,11331-11514)设计探针引物,标准曲线相关系数>0.99,灵敏度可达5×101拷贝.准确性重复性实验结果批内变异系数(CV)为0.88%~ 2.50%、批间CV为1.75% ~3.31%.8种病毒及临床48例患者复杂样本对照均为阴性.结论 ZEBOV核酸标签(KJ660348,11331-11514)在非编码区,在此基础上建立的荧光定量PCR方法可特异性检测ZEBOV,且灵敏、重复性好.关键词:扎伊尔型、埃博拉病毒、荧光定量PCR、标签序列、鉴定所属期刊栏目:38分类号:R373.9;R394.3;R446.9(医学微生物学(病原细菌学、病原微生物学))资助基金:全军后勤科研“十二五”计划重大项目AWS11C001;西南医院军事医学预研专项资助课题SWH2013JS03;Supported by the Major Project of "Twelfth Five-year Plan" of Logistic Scientific Research of PLA AWS11C001 and the Special Project of Military Preresearch of Southwest Hospital SWH2013JS03.在线出版日期:2016-08-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)页码:1471-1474 英文信息展示收起英文信息