基因芯片表达数据的标准化策略研究

摘要：

目的从统计学、数学和生物信息学相结合的角度,探讨针对不同密度基因芯片(microarray,gene chip)如何进行数据标准化处理与分析,寻找表达上有显著性差别的基因.方法在Excel和Spss软件中,采用总强度标准化法(totalintensity normalization,TIN)和局部加权线性回归标准化法(10cally weighted linear regression normalization,LWLRN)对高低密度芯片数据进行分析处理.结果这些方法能有效地减少系统误差产生的影响,使处理后的数据更加具有可比性和可靠性.结论本研究提供的分析方法在减少系统误差基础上能较好地找出芯片上有显著性差异表达的基因,不过标准化方法还处于起步和发展的阶段,需进一步完善;但随着非线性技术的不断完善,计算机软硬件的快速发展,芯片海量数据分析处理方面的研究将得到新的突破.

关键词：基因芯片(微阵列)、标准化因子、表达比、显著性差异

所属期刊栏目：26

分类号：R319;R394.2(医用一般科学)

资助基金：国家自然科学基金60371034

在线出版日期：2004-05-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：594-597