一种改进的多聚腺苷酸化位点提取方法
多聚腺苷酸化是真核生物基因表达的重要步骤.多聚腺苷酸化位点(Poly(A)位点)标识基因末端,准确识别poly(A)位点有利于确定成熟的mRNA.如果一个基因含有多个poly(A)位点,通过不同poly(A)位点的选择可以产生不同性质的mRNA(Alternative Polyadenylation,APA).全基因组3'末端测序技术产生了大量包含poly(A)位点信息的序列,如何从这些序列中快速有效地获取poly(A)位点成为生物学家关注的焦点.本文针对3'末端测序数据,通过Perl脚本和生物信息软件的综合利用,设计了poly(A)位点的全基因组提取流程,可有效提取poly(A)位点并对其进行注释,该方法优势是适用于多种物种,适用性广,且运行高效.
Poly(A)位点、3’末端测序技术、提取流程
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TP311(计算技术、计算机技术)
2018-09-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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