DNA序列分析系统的开发应用
20世纪90年代，人类基因组计划的启动，有力推动了DNA测序工作的发展。寻找某些特征片段（功能片段）在序列中的分布规律，对遗传学、生物信息学等都有重要的应用意义。在教学、研究中发现，应用数学分析软件MATLAB的字符串处理功能，可以容易地达到功能片段分析的目的，本系统通过分析DNA序列链之间的关联程度，构造出特征矩阵，根据模糊C均值算法较准确的对DNA序列的集合进行了分类，同时利用matlab的图像显示功能将聚类的最终结果清楚明了的显示在图像中，使用户能清楚的看到聚类效果。本系统主要研究了DNA链碱基序列分析、多个DNA链特征矩阵提取、模糊C均值聚类算法分类DNA等三大部分。首先该系统对DNA序列的总长度和功能序列的长度进行了测量，利用一维数组确定功能片段在DNA序列中的位置特征，从而完成了对DNA碱基序列的分析；其次该系统对用户给出的数个DNA链进行序列之间的特征分析，统计出每个序列的（A,T,C,G）碱基密度，得到一个特征矩阵，有效的为模糊聚类分析方法提供数据来源。最终该系统应用模糊C均值聚类算法，利用特征矩阵的数值，将数个DNA序列聚类并分为两类。
模糊C均值、特征片段、系统开发
TP311(计算技术、计算机技术)
2014-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共3页
5220-5222
