一种改进的基因功能相似度计算方法

摘要：

近年来,基于基因本体比较基因之间的功能相似度成为一个研究热点.当前,基因功能相似度计算方法可以分为2种类型:逐对(pair-wise)比较法和成组(group-wise)比较法.然而,由于基因本体注释数据的丰度问题,造成大量的基因具有相同的本体注释数据,从而导致基因功能相似度计算方法的结果存在偏差.本文提出一种改进的基因功能相似度计算方法,对注释集合的语义信息量进行归一化,达到准确度量基因之间的功能相似度的目的.实验结果表明:本文提出的方法可以消除相同注释对基因功能相似度计算方法的影响,且在测试平台上获得非常优秀的结果.

关键词：基因本体、基因功能相似度、相同注释、相似度归一化

所属期刊栏目：7

分类号：TP391.41(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金61571163, 61532014, 61671189, 61402132;国家重点研发计划课题2016YFC0901902

在线出版日期：2017-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：123-126