10.3969/j.issn.2095-2163.2016.01.027
基于样本熵的DNA序列相似性分析
针对传统方法在分析DNA序列相似性方面的不足,提出了一种基于样本熵的DNA序列相似性分析方法.以5种东亚钳蝎神经毒素的基因序列作为分析对象,首先通过DNA序列的图形表示把DNA序列转换为时间序列,然后运用样本熵算法计算出时间序列的样本熵值,将样本熵的互值大小作为分析序列之间相似性的依据,最后将样本熵方法与DTW(Dynamic Time Warping,动态时间弯曲)方法的实验结果进行比较.实验结果表明,样本熵分析方法能有效分析序列之间的相似性,与DTW分析方法相比较,显示出更强的相似性和区别度,可将其进一步应用于生物序列的分析.
样本熵、DNA序列、序列相似性、DTW距离
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TP391(计算技术、计算机技术)
2016-06-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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