系统发生网络构建算法综述

摘要：

物种的进化史通常被描述成一棵有根系统树,但是当物种进化过程中发生网状进化事件(如,杂交、重组和水平基因转移)时,物种的进化史不再适合被描述成系统树.系统发生网络是系统树的一般化,也是被用来描述物种的进化史,并可以描述物种的网状进化事件.而且系统发生网络也可以可视化冲突数据集,如由不同的基因得到的物种树.因此,系统发生网络的研究是生物信息的一个重要领域.介绍了系统发生网络的概念、发展、研究现状,总结了现有的系统发生网络构建算法.

关键词：系统发生网络、网状进化事件、隐式网络、显式网络

所属期刊栏目：4

分类号：TP301(计算技术、计算机技术)

资助基金：国家自然科学基金60932008,61172098;高等学校博士学科点专项科研基金20112302110040;中央高校基本科研业务费专项资金HIT.ICRST.2010022

在线出版日期：2014-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：32-34,37