基于CyClus3D聚类算法的PPI网络模体研究

摘要：

为了研究蛋白质间的相互作用关系,基于CyClus3D聚类算法对人类蛋白质参考数据库(HPRD)、人类相互作用组资源(HIR)和生物相互作用数据集存储库所构成的整合型蛋白质-蛋白质相互作用网络(BioGRID)进行网络模体挖掘,然后对网络模体所构成的子网络进行基因本体生物过程(GO)和基因组京都百科全书信号通道(KEGG)富集分析.实验结果表明:网络模体挖掘简化了蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,并且能够集中分析关键性的蛋白质.

关键词：蛋白质、蛋白质相互作用、CyClus3D聚类算法、网络模体、富集分析

所属期刊栏目：14

分类号：R318.04(医用一般科学)

资助基金：云南省应用基础研究计划项目2013FD038

在线出版日期：2016-03-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：39-42